A gyermek- és ifjúsághigiénés szakterület feladata a 0-24 éves korosztály testi, lelki, mentális fejlődését befolyásoló környezeti tényezők közegészségügyi felügyelete. Tevékenysége keretében folyamatosan figyelemmel kíséri a gyermek és ifjúsági intézmények tárgyi feltételeit valamint működési körülményeit, a nemkívánatos jelenségek észlelésekor hatósági intézkedéseket foganatosít.
Az NNK szakmai irányítási feladatkörében az osztály felügyeli, koordinálja, a megyei kormányhivatalok, valamint a népegészségügyi feladatkörükben eljáró járási (főváros, kerületi) hivatalok gondozó, nevelő és oktató intézmények (bölcsőde, óvoda, iskola stb.) valamint tevékenységek (játszóház, táboroztatás, játszótér stb.) közegészségügyi követelményeknek való megfelelőségére irányuló hatósági munkáját, melyhez szakmai támogatást nyújt.
A közegészségügyi felügyelet keretében az osztály koordinálásban a járási (főváros, kerületi) hivatalok rendszeresen felmérik a gyermekintézmények, úgymint a bölcsőde, óvoda, általános és középiskola továbbá egyéb, a gyermekek napközbeni felügyeletével összefüggő tevékenységek, mint táboroztatás, játszóterek, játszóházak jogszabályi előírásoknak való megfelelő működtetését.