Az OTNY működését az alábbi jogszabályoknak megfelelve végzi:
- évi CLIV. törvény az egészségügyről
- Fejezet: A betegek jogai és kötelezettségei 5-26. §,
- Fejezet: Szerv- és szövetátültetés 202-215. §,
XII. Fejezet: A halottakkal kapcsolatos rendelkezések 216-222.A §,
XVII. Fejezet: Nemzetközi rendelkezések 243. §,
18/1998. (XII.27.) EüM rendelet az egészségügyről szóló 1997. évi CLIV. törvénynek a szerv- és szövetátültetésre, valamint tárolásra és egyes kórszövettani vizsgálatokra vonatkozó rendelkezései végrehajtásáról,
- évi XLVII. törvény az egészségügyi és a hozzájuk kapcsolódó személyes adatok kezeléséről és védelméről,
- évi III. törvény a polgári perrendtartásról 196. §,
és a fenti jogszabályokban említett kapcsolódó jogszabályok.