A szűrés országos kiterjesztéséből eredő kapacitásnövekedés szükségessé tette a kolonoszkópos vizsgálatokat végző laboratóriumok hálózatának kialakítását, melynek feltétele volt, hogy kiválasztásra kerüljenek azon egészségügyi szolgáltatók, amelyek vagy már megfeleltek a minőségi kolonoszkópia feltételei teljesítésének vagy pedig a projekt által biztosított eszközök bevonásával a feladat ellátására képessé, alkalmassá válhattak.
Ahhoz, hogy az egészségügyi ellátórendszer megfelelően tudja ellátni a vastagbélszűrés első lépcsőjében kiszűrt lakosokat, szükség volt a közfinanszírozott gasztroenterológiai laboratóriumok működési körülményeinek vizsgálatára. A vastagbélszűrésben részvevő kolonoszkópos egységek kiválasztásánál elsődleges szempontnak tekintettük, hogy olyan egységek kerüljenek a szűrési hálózatba, akik a szűrés során biztosítani tudják a minőségi kolonoszkópia végzéséhez szükséges, minimálisan elvárt humánpolitikai és infrastrukturális feltételeit. Célunk az volt, hogy a területi lefedettséget biztosítva minél több kolonoszkópos egység váljon alkalmassá a magas szakmai minőségű vizsgálatok elvégzésére és csatlakozzon a vastagbélszűrési programhoz. Ennek megfelelően 57 szerződött kolonoszkópos egységben kerül sor a nem-negatív székletvérvizsgálati eredménnyel rendelkező lakosok tisztázó célú kolonoszkópos vizsgálatának elvégzésére.